R中自定义函数的等高线图

r plot contour

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我正在使用一些自定义函数,我需要根据参数的多个值为它们绘制轮廓。

这是一个示例函数:

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我需要绘制这样的等高线图:

在此输入图像描述

任何的想法?

谢谢。

作者: Mahmoud 的来源 发布者: 2013 年 9 月 29 日

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决定

首先,构造一个函数,fourvar将这四个参数作为参数。在这种情况下,您可以使用3个变量完成它,其中一个变量是lambda_1上的lambda_2。Alpha1固定为2,因此alpha_1 / alpha_2将在0-10之间变化。

fourvar <- function(a1,a2,l1,l2){ 
  a1* integrate( function(x) {(1-x)^(a1-1)*(1-x^(l2/l1) )^a2} , 0 , 1)$value }

诀窍是要意识到该integrate函数返回一个列表,你只想要该列表的'value'部分,因此它可以成为Vectorize()-ed。

其次,使用该函数构造矩阵:

  mat <- outer( seq(.01, 10, length=100),  
                seq(.01, 10, length=100), 
                Vectorize( function(x,y) fourvar(a1=2, x/2, l1=2, l2=y/2) ) )

那么在这些位置创建带标签的情节的任务只能轻松完成lattice::contourplot。在进行了合理的搜索后,似乎geom_contour标记的解决方案仍然是ggplot2中正在进行的工作。我发现的唯一标签策略是外部包装。但是,directlabel在这种情况下,'directlabels'软件包的功能似乎没有足够的控制来正确地传播标签。在我看到的其他例子中,它确实在标绘区域周围散布标签。我想我可以查看代码,但由于它依赖于'proto'包,它可能会被奇怪地封装,所以我没看过。

require(reshape2)
mmat <- melt(mat)
str(mmat) # to see the names in the melted matrix
g <- ggplot(mmat, aes(x=Var1, y=Var2, z=value) )
g <- g+stat_contour(aes(col = ..level..), breaks=seq(.1, .9, .1) )
g <- g + scale_colour_continuous(low = "#000000", high = "#000000") # make black
install.packages("directlabels", repos="http://r-forge.r-project.org", type="source")
require(directlabels)
direct.label(g)

请注意,这些是矩阵的索引位置而不是参数的比例,但这应该很容易修复。

在此输入图像描述

另一方面,这是在格子中构造它的容易程度(我认为它看起来“更干净”:

  require(lattice)
  contourplot(mat, at=seq(.1,.9,.1))

在此输入图像描述

作者: 42- 发布者: 29.09.2013 05:50

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由于我认为这个问题仍然存在,因此metR包装中的等高线图标签已经有了一些进展。添加到前面的示例将为您提供良好的轮廓标记ggplot2

require(metR)
g + geom_text_contour(rotate = TRUE, nudge_x = 3, nudge_y = 5)

标记轮廓图

作者: Gerhard Riener 发布者: 12.07.2019 09:21
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